C1

• automatický přípravný systém pro separaci a izolaci jednotlivých buněk s následující reverzní transkripcí a amplifikací nukleových kyselin
• připravené jednobuněčné templáty se mohou použít pro mRNA sekvenování, DNA sekvenování, epigentiku nebo miRNA expresi
• ve srovnání s 384 PCR formátem, C1 v jediném experimentu vygeneruje 24x více dat
• soustředěním a automatizací jednotlivých kroků do jednoho přístroje je možné zredukovat variabilitu způsobenou klasickým použitím různých platforem pro jednotlivé kroky
• jako u většiny systémů firmy Fluidigm, je fungování tohoto přístroje založeno na principu mikrofluidní technologie
• C1 izoluje jednotlivé buňky do individuálních reakčních komůrek (IFC)
• opticky čiré IFC umožňují kontrolovat pod mikroskopem jednotlivé fluorescentně značené buňky, lze tak zjistit jejich životnost, popřípadě sledovat značené povrchové markery
• buňky jsou pak automaticky zlyzovány a zpracovány a templát může být použit pro qPCR nebo sekvenační analýzu
• celý proces trvá méně než 4 hodiny

Pozitiva využití C1 přístroje:

• PŘESNOST: možnost detekovat rozdíly v heterogenních populacích s přesností jednotlivé buňky
• JEDNODUCHOST: jednoduchý izolační proces jednotlivých buněk s jasně definovaným experimentálním workflow
• RYCHLOST: minimalizovaný čas operátora díky automatizaci a velmi redukovaný čas ručního pipetování
• FLEXIBILITA: lze použít již předem připravené aplikace pro analýzu RNA a DNA nebo si sestavit vlastní protokol na C1 Open App (https://www.fluidigm.com/c1openapp)

 
Více informací naleznete zde.