Sekvenační kity metagenomika

Metagenomika je obor genetiky, který se zabývá sekvenováním DNA z různého prostředí za účelem popisu složení organismů ve vzorku včetně těch, které nelze kultivovat. Tímto způsobem se zkoumá například environmentální DNA, nebo střevní mikrobiota.

Sekvenování genů 16S rRNA se používá při studiu fylogeneze a taxonomie bakterií. Sekvenování 16s ribozomální RNA primárně slouží k identifikaci bakteriálních druhů v environmentálních vzorcích a uskutečňuje se pomocí amplikonového NGS. Revvity představuje 16S Amplicon-Seq Kits, což jsou kity pro zrychlenou přípravu knihoven pro platformu Illumina. Protokoly jsou automatizovatelné pro pipetovací roboty Sciclone® NGS and NGSx Workstations.

Identifikace bakterií

Kity NEXTFLEX 16S Amplicon-Seq umožňují analýzu celé mikrobiální komunity ve vzorcích neovlivněných kultivací na živné půdě. S možností poolovat stovky vzorků v jednom sekvenačním běhu, NGS 16s RNA sekvenování je citlivou a levnou metodou pro detekci kmenů, které nejsou identifikovatelné jinými metodami.

NEXTFLEX® 16S V4 Amplicon-Seq Kit 2.0
Validovaná příprava knihoven pro 16 V4 rRNA sekvenování pro platformu Illumina. 

NEXTFLEX® 16S V1-V3 Amplicon-Seq Kit
Validovaná příprava knihoven pro 16S V1-V3 analýzu bakteriálního metagenomu. 

Identifikace hub a mikroskopických druhů eukaryot

NEXTFLEX® ITS Amplicon-Seq Kit 
Nadesignovaný kit pro připravů multiplexovaných amplikonových knihoven, které pokrývají Internal Transcribed Spacer (ITS) region. ITS rRNA sekvenování zachycuje hypervariabilníi ITS1 a/nebo ITS2 lokusy, které se běžně používají pro fylogenezi eukaryotických organismů v komplexních komunitách. Kit je schopný používat extra malé množství vstupní DNA.

NEXTFLEX® 16S V4 and 18S Amplicon-Seq Kit 
Slouží pro validovanou připravu knihoven pro IZS metagenomiku eukaryotických vzorků. Culture free identifikace bakterií a hub a/nebo mikroeukaryot v rámci jednoho procesu přípravy knihoven. Kit NEXTFLEX® 16S V4 & 18S Amplicon-Seq umožňuje přípravu knihoven, které jsou cílené pro pokrytí 16S V4 regionů bakterii a 18S rRNA eukaryotů, což umožňuje sledování druhového složení a metagenomiky v komplexních vzorcích, které obsahují bakteriální, fungální a mikroeukariotyckou DNA. Validovaná připrava sekvenačních knihoven pro 16S V4 and 18S metagenomiku v rámci jednoho protokolu.